Hogere initiële kosten: Vergeleken met traditionele zonnepanelen op het dak hebben zonnedakpannen vaak hogere initiële investeringskosten.
Iets lagere energie-efficiëntie: Normaal gesproken kan de energie-omzettingsefficiëntie van zonnedakpannen iets lager zijn dan die van standaard zonnepanelen.
Schaarste aan installatiediensten: Momenteel zijn er relatief weinig bedrijven die installatiediensten leveren voor zonnedakpannen, wat tijdens het installatieproces enig ongemak kan veroorzaken.
